Pilna ģenomu kataloga izveide ir milzīgs uzdevums.
Pašlaik tiek īstenota grandioza zinātniskā iniciatīva, lai atšifrētu ģenētiskās secības 1,85 miljoniem eikariotu sugu, kas apdzīvo mūsu planētu. Bezprecedenta projekts Earth BioGenome Project (EBP) var radikāli pārveidot mūsu zināšanas bioloģijā, un mērķu sasniegšana tiek gaidīta līdz 2028. gadam. Procesa paātrināšana ir kļuvusi par realitāti, pateicoties mākslīgā intelekta ieviešanai, kas pētniekiem sniedz rīkus ne tikai datu par DNS ierakstīšanai un sistematizēšanai, bet arī nodrošina visaugstāko precizitāti, analizējot miljardus molekulāro komponentu.
Pilna ģenomu kataloga izveide gandrīz diviem miljoniem sugu ir milzīgs uzdevums, tomēr tā nozīmi bioloģisko zinātņu attīstībā ir grūti pārvērtēt. Lai gan līdz šim EBP ir sasniedzis tikai nelielu daļu no galīgā mērķa, progresīvās mākslīgā intelekta un automatizācijas tehnoloģijas ievērojami paātrina darbu. Piemēram, 2018. gadā izlaistais algoritms DeepVariant nodrošina precīzu cilvēka pilnas ģenoma secības atjaunošanu, pamatojoties uz datiem no sekvenēšanas sistēmām.
Šajā gadā ģenomikas speciālisti no Google Research prezentēja rīku DeepPolisher, kas paredzēts ģenoma kvalitātes uzlabošanai. Saskaņā ar izstrādātāju teikto, sistēma spēj samazināt kļūdu skaitu par 50 % un novērst ģenētisko variantu, kas saistīti ar slimībām, izlaidi anotācijas programmās, kas analizē izejas datus un nosaka gēnu funkcijas. Šādi rīki palīdz zinātniekiem izstrādāt slimību profilakses stratēģijas savvaļas dzīvniekiem un veidot efektīvas kampaņas sugu saglabāšanai, kas var izzust.
Spilgts piemērs veiksmīgai ģenomu tehnoloģiju izmantošanai ir kaķa papagaiļa – nespējīga lidot papagaiļa no Jaunzēlandes – izglābšanas stāsts. Līdz 2015. gadam šīs sugas populācija bija samazinājusies līdz kritiskajiem 49 indivīdiem, taču, pateicoties katras saglabājušās putna ģenomu analīzei, speciālisti spēja identificēt indivīdus ar vislielāko ģenētisko daudzveidību. Rezultātā izdevās palielināt populāciju līdz vairāk nekā 250 indivīdiem trīs paaudzēs.
Atstāt komentāru