Ir trīs metodes.
Kofeīna izdalīšanai izmanto organiskos šķīdinātājus, saspiestu oglekļa dioksīdu vai karstu ūdeni. Pēdējā gadījumā no kafijas pupiņām šķīdumā nonāk ne tikai kofeīns, bet arī aromātiskās vielas.
Ūdeni attīra no kofeīna, pēc tam tajā iemērc jaunu kafijas pupiņu partiju. Tā kā ūdens jau ir piesātināts ar aromātiskajām vielām, tas no jaunās partijas pupiņām izvelk tikai kofeīnu, neietekmējot citas sastāvdaļas.
